作為控制航運業排放最直接的措施，船東可能會被要求為他們所造成的污染支付燃料稅。外交團將在今年12月舉行的巴黎氣候大會（COP21）上提交征收燃油稅議案，旨在減少來自航運業的溫室氣體排放。

此措施是在包括全行業的二氧化碳減排目標、碳排放交易計劃和加強技術管理等措施均不可行或太復雜之后提出的。

支持征稅想法的一個關鍵因素是，燃料價格已被發現是運輸行業效率和減排的最大驅動。生態船的急速發展及2008后廣泛被采用的減速航行，都是為了應對隨全球經濟衰退呈雙倍增長的燃料價格（每噸達600美元）。

近年來，氣候變化問題受到重視。國際海事組織（IMO）2014溫室氣體排放研究顯示，2012年國際航運業二氧化碳排放量達7.96億噸，約占全球碳排放量的2.2%，相較2007年航運業二氧化碳排放量的8.85億噸，全球碳排放總量占比減少0.6%。然而IMO研究報告指出，如果航運業對碳排放不加控制，2050年航運業碳排放仍面臨50%~250%的增長。

一位評論員表示：“IMO的研究顯示，伴隨世界貿易增長，航運業的總減排目標符合國家在COP21承諾的目標是不太可能實現的。”另一些觀點認為，如果他們是在石油噸里數基礎上設置的，減排目標是有可能實現的。

在污染方付費前提下，燃料稅將會被普遍應用。因為這相較許多排放交易計劃，更簡單且直接。